1991年，喷鼻港黑帮三合会会员刘健明服从垂老韩琛(曾志伟 饰)的交托，进进差人部队成为黑帮卧底，韩琛允诺刘健明会帮其在七年后提升为见习督察。1992年，差人练习黉舍优异学员陈永仁(梁朝伟 饰)被下级要求深进到三合会做卧底，终纵方针是成为韩琛身旁的红人。2002年，两人都不负重看，也都身背重压，刘健明渐想成为一个真实的大好人，陈永仁则盼着尽快回回差人身份。 重案组从陈永仁手中得悉一批毒品买卖情报，锁紧方针人物韩琛，没料情报被刘健明泄出，两边动作均告掉败。但此事将两边均有卧底的事实露出，激起两边高层中断根内鬼的决心。命运悬殊又相似的刘健明和陈永仁开端在无间道的旅程中接收严重考验。
